期刊简介
本刊是综合性学术期刊，主要刊登人工器官、生物材料、生物力学、生物信息与控制、生物医学测量、医药工程、生物工程、中医工程、计算机在医学中的应用、医疗器械等方面的理论研究和最新成果。适合从事生物医学工程的科研、工程人员及临床医生阅读，面向国内外公开发行。
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首页>北京生物医学工程杂志
- 杂志名称：北京生物医学工程杂志
- 主管单位：北京市卫生健康委员会
- 主办单位：北京市心肺血管疾病研究所
- 国际刊号：1002-3208
- 国内刊号：11-2261/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：北京市优秀作品编辑奖（89）期刊收录：维普收录(中), 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
针对无标签鸟枪法蛋白质定量的新方法
江丹阳；郑浩然
关键词：质谱分析法, 鸟枪法蛋白质组学, 退化肽段, 蛋白质绝对定量, 多肽
摘要：目的 通过所检测到的肽段丰度计算蛋白质丰度是蛋白质组学的一个重要部分.由于退化肽段的丰度可能由多个蛋白质提供,简单剔除退化肽段可消除这种不确定性并简化问题.但是由于退化肽段的信息没有被充分利用,蛋白质定量的准确性会受到影响,还可能显著降低可以定量的蛋白质规模.如何充分利用退化肽段的信息,提高蛋白定量的准确性和全面性,并且不会导致问题规模更为复杂,成为一个重要的问题.方法 为了在不引入更多误差的情况下充分利用退化肽段来进行更准确的定量,本文提出一个基于误差小化的方法(error-minimization-based quantification for protein,EMQ).不同于以往的大多数算法,EMQ利用退化肽段中的信息,大限度地将肽段层面信息还原到蛋白质层面,得到了更多的蛋白质定量结果并提高了结果的精度.结果 多个实验数据上的表现证明本方法可以在较小的时间代价下获得更高的精度,并提高结果的规模.结论 本文提出的基于误差小化的方法可以快速准确地对大规模蛋白质组学问题进行定量.
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