期刊简介

本刊是综合性学术期刊,主要刊登人工器官、生物材料、生物力学、生物信息与控制、生物医学测量、医药工程、生物工程、中医工程、计算机在医学中的应用、医疗器械等方面的理论研究和最新成果。适合从事生物医学工程的科研、工程人员及临床医生阅读,面向国内外公开发行。

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  • 杂志名称:北京生物医学工程杂志
  • 主管单位:北京市卫生健康委员会
  • 主办单位:北京市心肺血管疾病研究所
  • 国际刊号:1002-3208
  • 国内刊号:11-2261/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:北京市优秀作品编辑奖(89)期刊收录:维普收录(中), 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
北京生物医学工程杂志2016年第03期

单核苷酸多态性JSON文件的转换

王潘章

关键词:单核苷酸多态性, JSON, Node.js, 文件转换
摘要:目的 对SNP原始文本格式转换成规范JSON格式,便于计算机软件分析人类的基因.方法 利用Node.js流函数pipe对庞大的SNP原始文本文件进行分段读取进内存并转换成规范的JSON格式,后分段地写入到一个终结果文件中去.结果 针对不同基因测序厂商提供的检测结果,提供了一种相对规范的JSON格式,开发出了转换工具包.结论 采用JSON文件格式可以较好、较简单地对多厂商的SNP原始文本文件进行规范的表达,使用Node.js开发的转换工具效率较高.