期刊简介
本刊是综合性学术期刊，主要刊登人工器官、生物材料、生物力学、生物信息与控制、生物医学测量、医药工程、生物工程、中医工程、计算机在医学中的应用、医疗器械等方面的理论研究和最新成果。适合从事生物医学工程的科研、工程人员及临床医生阅读，面向国内外公开发行。
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首页>北京生物医学工程杂志
- 杂志名称：北京生物医学工程杂志
- 主管单位：北京市卫生健康委员会
- 主办单位：北京市心肺血管疾病研究所
- 国际刊号：1002-3208
- 国内刊号：11-2261/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：北京市优秀作品编辑奖（89）期刊收录：维普收录(中), 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
基于贝叶斯决策理论的磷酸化位点蛋白激酶识别算法
邹亮；李骜；韩燕；冯焕清；王明会
关键词：蛋白激酶, 磷酸化, 贝叶斯决策理论, 生物信息学
摘要：通过提出一种新颖的生物信息学算法，以准确识别已知磷酸化位点的蛋白激酶信息，进而解决蛋白激酶的信息缺乏问题。方法根据人类激酶的聚类规则，首先从新版本的磷酸化数据库Phospho．ELM（9.0）中提取出激酶特异性的磷酸化数据，构建用于激酶识别的数据集。然后基于贝叶斯决策理论，分析阳性数据和阴性数据中磷酸化位点附近的氨基酸分布规律，进而给出相应的统计模型并使用留一法对模型进行评估。结果对 MAPK、PKA 和 RSK 3个激酶家族的测试表明，在假阳性率不超过1％的高置信度水平下，激酶识别的准确率分别达到了23％、24％和33％。同时，该算法的识别结果明显优于 KinasePhos、Netphosk 等蛋白质磷酸化位点预测方法。结论本文提出的基于贝叶斯决策理论的磷酸化位点激酶信息识别算法可有效提高对已知磷酸化位点的蛋白激酶识别性能，有助于理解蛋白质磷酸化的生物机制。
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