期刊简介

本刊是综合性学术期刊,主要刊登人工器官、生物材料、生物力学、生物信息与控制、生物医学测量、医药工程、生物工程、中医工程、计算机在医学中的应用、医疗器械等方面的理论研究和最新成果。适合从事生物医学工程的科研、工程人员及临床医生阅读,面向国内外公开发行。

首页>北京生物医学工程杂志
  • 杂志名称:北京生物医学工程杂志
  • 主管单位:北京市卫生健康委员会
  • 主办单位:北京市心肺血管疾病研究所
  • 国际刊号:1002-3208
  • 国内刊号:11-2261/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:北京市优秀作品编辑奖(89)期刊收录:维普收录(中), 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
北京生物医学工程杂志2013年第02期

基于压缩感知算法的基因表达谱数据分析

任丛林;王瑞平

关键词:压缩感知, 稀疏化, 冗余字典, 基因表达谱
摘要:目的 基因表达谱数据分析是生物信息学领域重要的研究内容之一.其可实现对不同病理分型的肿瘤的正确分类,对肿瘤诊断和治疗具有重大意义.方法 本文应用压缩感知算法实现对胃癌基因表达谱数据的分类,运用训练数据构造冗余字典,采用随机分布的规范行矢量高斯矩阵构造感知矩阵,对训练数据和测试数据进行感知,利用正交l2-范数算法对基因表达谱数据进行重建,在变换域中采用近邻法测试判断数据类别,与样本的实际类别相比较.结果 实验结果表明,压缩感知算法与K均值聚类、SVM等其他分类算法相比有较高的分类正确率,且分类速度快,能避免特征选取的问题.结论 本文方法对疾病的临床诊断和生物信息学研究有重要的参考和借鉴作用.